Revisão do ESM Atlas

ESM Atlas é uma ferramenta de previsão e exploração de estrutura proteica desenvolvida pela Biohub (uma iniciativa da Chan Zuckerberg Initiative) que permite a pesquisadores em metagenômica e ciência de proteínas acessar e explorar bilhões de estruturas proteicas metagenômicas previstas. Serve como um recurso aberto para descoberta biológica e design de proteínas. A plataforma organiza e torna navegável um imenso conjunto de dados de biologia de proteínas, abrangendo atualmente 6,8 bilhões de sequências de proteínas e 1,1 bilhão de estruturas previstas. Ela utiliza IA para identificar e revelar relações entre proteínas que bancos de dados tradicionais podem não ter capturado, incluindo ligações evolutivas entre enzimas de edição genética distantemente relacionadas. Esta iniciativa visa acelerar a descoberta terapêutica, transformando a triagem empírica em design guiado por computação.

O ESM Atlas oferece um conjunto abrangente de recursos projetados para facilitar a pesquisa e descoberta de proteínas, utilizando modelos avançados de IA para oferecer acesso incomparável a dados estruturais de proteínas. Suas capacidades se estendem desde o acesso básico a dados até o suporte a fluxos de trabalho complexos de design de proteínas.

O ESM Atlas é projetado principalmente para a comunidade científica engajada em pesquisa de proteínas, bioinformática e desenvolvimento terapêutico. Sua natureza aberta e vasto conjunto de dados o tornam um recurso valioso em múltiplas disciplinas.

O Biohub ESM Atlas, juntamente com seus modelos associados ESMC e ESMFold2, está disponível gratuitamente para a comunidade científica global. Os modelos são lançados sob uma licença MIT, e os dados estão disponíveis sob uma licença CC BY 4.0, permitindo o uso acadêmico e comercial sem restrições. Embora os modelos e dados centrais sejam abertos, o serviço Atlas em si opera em um modelo freemium, com o acesso à API sendo limitado por taxa para garantir o uso justo dos recursos compartilhados. Os usuários são aconselhados a gerenciar suas solicitações para evitar o uso excessivo.