Revisión de ESM Atlas

ESM Atlas es una herramienta de predicción y exploración de la estructura de proteínas desarrollada por Biohub (una iniciativa de la Chan Zuckerberg Initiative) que permite a los investigadores en metagenómica y ciencia de proteínas acceder y explorar miles de millones de estructuras de proteínas metagenómicas predichas. Sirve como un recurso abierto para el descubrimiento biológico y el diseño de proteínas. La plataforma organiza y hace navegable un inmenso conjunto de datos de biología de proteínas, que actualmente abarca 6.8 mil millones de secuencias de proteínas y 1.1 mil millones de estructuras predichas. Aprovecha la IA para identificar y sacar a la luz relaciones entre proteínas que las bases de datos tradicionales podrían no haber capturado, incluidos los vínculos evolutivos entre enzimas de edición genética distantemente relacionadas. Esta iniciativa tiene como objetivo acelerar el descubrimiento terapéutico transformando el cribado empírico en un diseño guiado por computación.

ESM Atlas proporciona un conjunto completo de características diseñadas para facilitar la investigación y el descubrimiento de proteínas, aprovechando modelos avanzados de IA para ofrecer un acceso sin precedentes a datos estructurales de proteínas. Sus capacidades se extienden desde el acceso básico a datos hasta el soporte de flujos de trabajo complejos de diseño de proteínas.

ESM Atlas está diseñado principalmente para la comunidad científica dedicada a la investigación de proteínas, la bioinformática y el desarrollo terapéutico. Su naturaleza abierta y su vasto conjunto de datos lo convierten en un recurso valioso en múltiples disciplinas.

El Biohub ESM Atlas, junto con sus modelos asociados ESMC y ESMFold2, está disponible gratuitamente para la comunidad científica global. Los modelos se lanzan bajo una licencia MIT, y los datos están disponibles bajo una licencia CC BY 4.0, lo que permite su uso académico y comercial sin restricciones. Si bien los modelos y datos principales son abiertos, el servicio Atlas en sí opera bajo un modelo freemium, con el acceso a la API limitado por tasa para garantizar un uso justo de los recursos compartidos. Se aconseja a los usuarios que gestionen sus solicitudes para evitar el uso excesivo.